ในทางชีววิทยา เพื่ออธิบายสิ่งมีชีวิตเฉพาะที่เป็นของสัตว์ เชื้อรา หรือพืช ระบบการตั้งชื่อของมันเองได้รับการพัฒนา มันสะท้อนถึงความเป็นของหนึ่งสายพันธุ์ขึ้นอยู่กับลักษณะของสัณฐานวิทยาและลักษณะที่ปรากฏ สำหรับสัตว์ เกณฑ์สำหรับการอ้างอิงถึงชนิดพันธุ์จะถูกนำไปใช้ ขึ้นอยู่กับความสามารถในการผลิตลูกหลานที่อุดมสมบูรณ์ในระหว่างการปฏิสนธิ อย่างไรก็ตาม รูปแบบเหล่านี้ใช้ได้กับสิ่งมีชีวิตเหล่านี้เท่านั้น ในขณะที่จุลินทรีย์ไม่สามารถจำแนกด้วยวิธีนี้ได้
แนวคิดของความเครียดในจุลชีววิทยา
เนื่องจากการมีอยู่ของสิ่งมีชีวิตจำนวนมากที่มีคุณสมบัติทางสัณฐานวิทยา แต่มีลักษณะทางชีวเคมีและภูมิคุ้มกันที่แตกต่างกัน จึงเป็นไปไม่ได้ที่จะใช้ระบบการตั้งชื่อมาตรฐานสำหรับการตั้งชื่อ เป็นผลให้มีการแนะนำแนวคิดเช่นความเครียด นี่คือวัฒนธรรมของจุลินทรีย์บริสุทธิ์ที่ถูกแยกออกและถูกแยกออกไป ณ ที่ใดที่หนึ่งในเวลาใดเวลาหนึ่ง
จุลินทรีย์แต่ละชนิดที่อยู่ในสายพันธุ์หนึ่งมีความคล้ายคลึงกับตัวแทนดังกล่าวในแง่ของเกณฑ์ทางชีวเคมี สัณฐานวิทยา ภูมิคุ้มกันและพันธุกรรม แต่ภายในแบคทีเรียชนิดเดียวกันนั้นไม่มีการเปรียบเทียบดังกล่าว ดังนั้น สายพันธุ์จึงเป็นชื่อที่ยืดหยุ่นกว่าสำหรับการเพาะเลี้ยงเชื้อจุลินทรีย์ เพราะเร็วการแลกเปลี่ยนสารพันธุกรรม (การกลายพันธุ์) นำไปสู่การเกิดขึ้นของสิ่งมีชีวิตใหม่ภายในสายพันธุ์ แต่ด้วยคุณสมบัติที่แตกต่างกัน คำจำกัดความนี้ช่วยให้เราระบุลักษณะการก่อโรคและปัจจัยที่ทำให้เกิดโรคได้แม่นยำยิ่งขึ้น
แบคทีเรีย
การตั้งชื่อแบคทีเรียที่มีอยู่ทำให้สามารถจำแนกประเภทของสิ่งมีชีวิตได้ แต่ไม่ได้ระบุคุณสมบัติใหม่ของพวกมัน สิ่งหลังนี้เกิดขึ้นจากการกลายพันธุ์อย่างรวดเร็ว ได้รับคุณสมบัติใหม่ รวมถึงคุณสมบัติที่ทำให้เกิดโรคในมนุษย์ สัตว์ในฟาร์ม และพืช ตลอดจนจุลินทรีย์อื่นๆ ตัวอย่างของระบบการตั้งชื่อโดยใช้ตัวอย่างของ Escherichia coli มีลักษณะดังนี้: อาณาจักร - แบคทีเรีย, ประเภท - Proteobacteria, คลาสของแกมมา-โปรตีโอแบคทีเรีย, ลำดับ - Enterobacteriales, ตระกูล Enterobacteria สกุลคือ Escherichia และสายพันธุ์คือ Escherichia colli อย่างไรก็ตาม มีแบคทีเรียหลายชนิดในสายพันธุ์ Escherichia colli ซึ่งแสดงคุณสมบัติที่แตกต่างกัน พวกมันถูกแยกออกเป็นแบคทีเรียหลายสายพันธุ์และมีชื่อเพิ่มเติม ตัวอย่างเช่น Escherichia colli O157:H7.
E. coli นั้นมีอยู่ในลำไส้ของมนุษย์และไม่ก่อให้เกิดโรค แต่สายพันธุ์ O157:H7 นั้นทำให้เกิดโรคได้โดยเฉพาะเนื่องจากมีปัจจัยก่อโรคจำนวนมาก เธอประสบกับการแพร่ระบาดของโรคลำไส้แปรปรวนในช่วง 5 ปีที่ผ่านมา
ไวรัสสายพันธุ์
แนวคิดของสายพันธุ์คือชื่อที่ยืดหยุ่นได้สำหรับสิ่งมีชีวิตที่มีคุณสมบัติเดียวกันกับที่ถูกแยกออกมา จากนั้นจึงระบุและอธิบายในบางพื้นที่ในช่วงเวลาหนึ่ง ไวรัสสามารถได้รับคุณสมบัติใหม่เนื่องจากแอนติเจนดริฟท์. สิ่งนี้จะสร้างไวรัสสายพันธุ์ใหม่ ซึ่งอาจก่อโรคได้มากกว่าพ่อแม่
คุณสามารถแสดงให้เห็นการเกิดขึ้นของสายพันธุ์ใหม่ได้อย่างชัดเจนโดยใช้ตัวอย่างของไวรัสไข้หวัดใหญ่ มันเป็นของตระกูล Orthomyxoviruses และตั้งชื่อตามแอนติเจน (hemagglutinins และ neuraminidase) HxNy X และ Y เป็นค่าตัวเลขที่สะท้อนถึงการมีอยู่ของแอนติเจน ตัวอย่างคือ H5N1 ซึ่งเป็นที่รู้จักจากการระบาดของไข้หวัดหมูเมื่อเร็วๆ นี้ด้วยโรคปอดอักเสบจากเลือดออกที่ลุกลามอย่างรวดเร็ว ตามทฤษฎีแล้ว สายพันธุ์ใหม่และที่อันตรายกว่าสามารถพัฒนาได้จากสายพันธุ์นี้เนื่องจากการเคลื่อนตัวของแอนติเจนเดียวกัน
เชื้อราและสายโปรทิสต์
เชื้อราเป็นตัวแปรที่น้อยที่สุดในบรรดาจุลินทรีย์ทั้งหมด แม้ว่าชีวเคมีของพวกมันจะซับซ้อนเช่นกัน เนื่องจากโครงสร้างที่ซับซ้อนกว่าแบคทีเรียและไวรัส และเนื่องจากขาดกลไกในการถ่ายโอนยีนอย่างรวดเร็ว จำนวนของเชื้อราสายพันธุ์ใหม่จึงเพิ่มขึ้นเล็กน้อย นอกจากนี้ยังมีความเห็นว่าสายพันธุ์เชื้อราที่ค้นพบใหม่เป็นสิ่งมีชีวิตที่มีอยู่ก่อนแล้วซึ่งไม่ได้พบโดยนักวิจัย
มีสถานการณ์คล้ายกันในอาณาจักรของผู้ประท้วง ความสามารถในการกลายพันธุ์ของพวกมันต่ำ ดังนั้นโอกาสที่สายพันธุ์ใหม่จะปรากฏขึ้นอย่างรวดเร็วจึงน้อยมาก อย่างไรก็ตาม สิ่งมีชีวิตสายพันธุ์เดียวกันยังคงปรากฏรูปแบบใหม่ ดังนั้นจึงเห็นได้ชัดว่าพวกมันมีอยู่ก่อนหน้านี้แต่ไม่ถูกค้นพบ
